Muzeum Diecezjalne w Pelplinie dysponuje własną pracownią konserwacji zabytków. W niej poddawane pielęgnacji lub zabiegom odtwórczym są dzieła sztuki sakralnej, które następnie wchodzą najczęściej w skład zasobów Muzeum. W głównej mierze przedmiotem prac są zabytki rzeźbiarskie i malarskie w mniejszym stopniu tkaniny.